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Lorsque le client saisit le numéro de carte, la date d'expiration et le mot de passe virtuel, la page d'authentification de la banque s'ouvre. Cette fenêtre affiche le logo de la banque, un espace pour saisir un code unique et parfois un compte à rebours indiquant le temps restant jusqu'à la vérification du code avant l'annulation de la transaction.
Toutefois, il est important de noter que diverses études ont montré que 3D Secure s'intègre de plus en plus dans les habitudes de client et qu'ils s'y familiarisent de plus en plus. Les pertes liées à la fraude au paiement par carte de crédit en ligne peuvent être plus dommageables, notamment pour l’authentification forte du commerce électronique.